Главный заповедник страны - Мурагес, который простирается от Рура до Режины и известен своими разнообразными пейзажами и флорой. Болота Кау около Рура являются прибежищем многих разновидностей птиц, но визитной карточкой этих мест являются туканы и фламинго, а примыкающая к океану часть Маре-де-Кау (Мараи-де-Кау-Рура) находится в списке заболоченных земель всемирного значения.
Региональный заповедник Тресор охватывает обширные области тропического леса и влажной саванны в южной части страны. Национальный заповедник Амана защищает прибрежные районы, являющиеся местами кладки яиц исчезающих морских черепах. А горный заповедник Анимальере-Макуринн, или Махури, считается одним из последних регионов естественного обитания ягуаров, оцелотов и тапиров на территории страны.
