В Намибии функционирует и железная дорога. Это очень медленный (средняя скорость поезда около 30 км/ч), но очень дешевый вид транспорта (поезда товарно-пассажирские, а потому достаточно "шумные"). Поезда компании TransNamib Starline курсируют между большинством главных городов страны, и имеют вагоны первого (билет стоит около 70 намибийских долларов при поездке через всю страну) и второго классов (около N$50). Пенсионеры имеют право на скидку в 33% на все виды билетов. На ночных рейсах места первого класса преобразовывают в четыре спальных места, во втором классе - в шесть. Дети в возрасте до 2 лет путешествуют бесплатно, в возрасте от 2 до 11 лет - за половину тарифа.
Роскошный туристический поезд Экспресс Пустыни (The Desert Express), выполняет регулярные рейсы между Свакопмундом и Виндхуком, делая в пути несколько остановок для осмотра достопримечательностей.
